Les communes du territoire intégrées au site Natura 2000 sont, pour la plupart des communes rurales avec une activité dominée par l'agriculture. Ce secteur représente une part importante avec près de 61% des établissements actifs sur la commune de Bostorhel, 57% sur la commune de Lannéanou et près de 44% sur la commune de Guimaëc orientée vers une agriculture légumière, tendance que l'on retrouve sur les communes littorales.
La commune de Plouigneau est également très attractive sur le territoire avec un pôle économique bien développé, notamment en matière d'artisanat et de commerce (près de 43% des établissements actifs). La commune de Guerlesquin se distingue par sa dynamique économique, liée notamment à son pôle agroalimentaire.
L'activité économique des communes littorales, comme Locquirec et Plestin-Les-Grèves, est "tournée" vers la mer et ces communes possèdent une dynamique touristique importante.
